Dù đã xóa bỏ 100 lối đi tự mở trên tuyến đường sắt dài 283km qua Gia Lai, Đắk Lắk và Khánh Hòa, nhưng đến nay vẫn còn 170 vị trí tiềm ẩn nguy cơ mất an toàn. Trong khi đó, việc đầu tư hạ tầng thay thế còn hạn chế, thiếu kinh phí và vướng cơ chế khiến tiến độ xử lý lối đi tự mở tiếp tục gặp nhiều khó khăn.
Được xây dựng nhằm đảm bảo an toàn đường sắt, song người dân xã Quang Trung (Thanh Hoá) cho rằng cầu vượt có độ dốc lớn, khó sử dụng.
Bộ GTVT thống nhất xây nút giao khác mức QL5 vượt đường sắt Hà Nội - Hải Phòng trên địa phận tỉnh Hải Dương với kinh phí từ nguồn ngân sách địa phương.
Thanh Hóa đề xuất xây 2 cầu vượt đường sắt Hà Nội - TP.Hồ Chí Minh trên Đường tỉnh 512 và đường Nghi Sơn - Bãi Trành.